水軍大敗之後，朝鮮王李昖的危機感大增，對於元均再次出動的勝率也沒有把握，想來想去覺得靠不住，因此又想起陸師。可是朝鮮陸師的戰績比水軍更糟，對於再次大舉進攻而來的倭軍陸師，李昖更加不敢抱什麼希望。
這樣一來, 他下意識又想到了曾經拯救他和朝鮮於將亡之際的明軍來，連忙找人來問，才知道此時明軍雖然名義上調動了大軍準備南下，可是這支大軍磨磨蹭蹭在遼東整備，已經拖了一個多月, 還是不肯過鴨綠江。
李昖倒抽一口涼氣, 又問在朝明軍的情況，獲悉在朝明軍不到一萬, 其中五千在漢陽，三千在平壤。再問之下更是大驚失色，因為有證據顯示駐守漢陽的宋應昌宋經略似乎正在打點行裝準備動身。
宋應昌目前直轄的漢陽明軍只有五千人，此時打點行裝總不可能是要南下去和日軍開戰，那他打算去哪？用腳指頭都能想到只能是北撤！
明軍要走？明軍居然要走！
李昖這下子已經不是倒抽一口涼氣，而是直接一股寒氣從腳底直衝腦門，整個人都涼了個徹底，全身上下不可抑止地發起抖來——這可不是被凍的，是被嚇的。
別看朝鮮此前又是爭指揮權，又是干涉明軍決策，真要讓他們獨自面對日軍而沒有明軍做中堅，他們根本沒那個能力。
就不說讓明軍做中堅了，哪怕能有明軍壓陣，哪怕明軍的人數少點，只要能打出一面明軍的旗幟在後方，朝鮮軍好歹也還有勇氣往前壓。
可是，如果完全沒有明軍參戰，只讓他們單獨去面對日軍……「見賊而逃者為上勇, 望風而逃者為中勇，誤聽而逃者為下勇」這句話差不多就可以拿出來做戰場記錄了。
李昖對此也是有了解的，因此在一陣惶惶之後總算想起來應該爭取挽救，他立刻派人通知柳成龍，命柳成龍去找宋應昌打聽明軍行止，如果明軍真要走，那就一定得想辦法留住他們。
柳成龍接到王令之後也是大吃一驚，他近來一邊憂心日軍進犯，一邊又忙着搭救李舜臣，着實對明軍方面的動向忽視得厲害，竟然不知道明軍有要北撤的跡象，獲悉之後連忙趕往明軍在漢陽的經略行轅，遞拜帖求見宋應昌。
宋應昌倒是很大方，坦坦蕩蕩接待了柳成龍。雙方一見面，柳成龍顧不得寒暄，直接問道：「聽聞天兵意欲拔營，不知經略是否打算南下平定倭寇？是否有需要朝鮮軍民配合之處？」
這話問得有點謀略，既能達到探尋明軍動向的目的，又給宋應昌留足了面子。可惜宋應昌不打算配合，微微一笑道：「領相誤會了，我軍並非要南下，而是北上。不僅漢陽方面，就連平壤方面也一樣，都將暫時撤回遼東。」
「倭寇已然再犯朝鮮，天兵豈能此時北撤？」柳成龍火急火燎地道：「何況這般大事，經台怎的竟未與我朝鮮上下提前說明？」
宋應昌微微挑眉，但語氣卻淡淡的：「怎麼，朝鮮軍如何作戰你們不肯接受上國指揮，如今甚至連我上國天兵之行止都要反過來向你們稟報了？」
柳成龍聽了這話才想起自己剛才的語氣有問題，解釋道：「在下不是這個意思，在下的意思是說如今朝鮮再次面臨倭寇進犯，經台作為上國派駐朝鮮的平倭主帥，此時正是領導平倭作戰之時，怎麼反而將天兵撤回遼東呢？這實在是……」
「你是說本部堂臨陣脫逃麼？」宋應昌打斷他的話反問道。
「在下自然不是這個意思，只是對於經台的打算實在難以理解。」柳成龍強壓着情緒道。
「駐朝明軍撤回遼東一事並非本部堂的決斷，而是奉高閣老之命行事。」
宋應昌平靜地說着，面上似乎還隱約帶着三分笑意：「高閣老說，針對日軍前次作戰所表現出的特點，我部駐朝明軍需要回遼東整編一番，不僅是要在技戰術上做出一些適應性的調整，而且更重要的是需要重新調整和配置武器裝備。
這些事情無法在朝鮮完成，同時考慮到日軍已經再次進犯，我軍的行動還必須加快，以免屆時救援不及……總之這件事不僅要辦，而且還得從速。也正因如此，如果領相沒有其他事見告，就請先回去吧，本部堂這裏諸事繁雜，有些不便招待。」
之後不管柳成龍怎麼說，宋應昌就一口咬定是奉了高閣老之命，必須立刻撤回。甚至他還暗示柳成龍，高閣老的命令不止是下達給他，留在朝鮮駐守的戚金、吳惟忠等南軍將領都直接收到了命令。因此，即便自己願意暫緩北撤也沒用，高閣老在軍中的威望無人可及，戚金、吳惟忠等人絕對不會抗命。
柳成龍無奈，只好馬不停蹄趕去王宮匯報情況，李昖聽了這話，一時手足無措，慌慌張張道：「這可如何是好？天兵一旦北撤，倭寇十幾萬大軍無人可擋，那還不得一路進逼漢陽？難道寡人又要播遷了嗎？」
柳成龍心裏雖然擔憂局面，但聽了這話也是氣不打一處來，道：「王上，朝鮮之安寧豈可盡寄希望於明國？我軍自倭寇退卻以來痛定思痛，也一直在加強訓練，如今同樣也有十餘萬大軍，怎麼就不能依靠自己阻擋倭軍北上？至少……也要在明軍再次南下前擋住倭軍攻勢才行啊，要不然屆時面對強勢明軍，我朝鮮好不容易爭取來的獨立作戰之權安能繼續？」
「擋住倭軍？說得輕巧，現在還能擋住嗎？」李昖怒道：「水軍現在還能指望麼？」
這話柳成龍哪敢隨便接，只能答道：「那也總得一戰才知結果。」
李昖咬了咬牙，道：「那就再給元均一次機會，若是此番再敗……哼！」
不知道自身責任又重了幾分的元均，在返回閒山島後立誓全力破敵，但此時水軍營中士氣已然低迷到了極點，可是又不得不繼續隨元均出戰。
這月十四，朝鮮水軍再度從閒山島出發，日軍脅坂安治得知，立即向九鬼嘉隆匯報。九鬼嘉隆令藤堂高虎引誘朝鮮水軍至漆川梁海域，令脅坂安治和加藤嘉明於漆川梁海域附近待命，並通知陸軍與巨濟島方面準備接應。
藤堂高虎與元均船隊相遇後故技重施，再度調轉方向撤離。朝鮮眾將皆勸此必為誘敵，絕對不可追擊，元均卻苦笑道：「我知此為倭寇誘敵之計，但眼下王命難違，我軍如若再退，我等同樣難逃一死。橫豎都是死，那不如與敵全力一戰！
諸位，我軍的火力仍在倭寇之上，這就是我們的倚仗，鼓起勇氣來！隨我殺退倭寇，將他們全部水葬！」顯然，此時的元均已有視死如歸之心，明知必然中計但因擔憂被朝廷嚴懲，也只能下定決心領全軍繼續追擊。
朝鮮水軍於十五日晚到達巨濟島海峽的漆川梁附近，十六日拂曉追擊藤堂高虎進入漆川梁。漆川梁水域極為狹窄，元均雖然追來但也不敢輕進，只派少數船隻進入試探。
藤堂高虎船隊見狀停止行駛，以五艘鐵甲安宅船正面迎向朝鮮水軍，號令全隊持續向朝鮮戰船射擊。元均於外觀察良久，並未探查到異樣，為儘快殲滅藤堂高虎，元均終領水軍全部向藤堂高虎逼近。
待朝鮮水軍全部進入漆川梁後，島上的日軍物見番立刻發出煙火信號，脅坂安治及加藤嘉明領所部水軍漸漸封堵海口，向內快速逼近。
此時藤堂高虎的誘餌船隊面對朝鮮水軍的火炮已苦不堪言，但即便腹背受敵，朝鮮水軍在狹窄海域內卻不能有效展開，無法形成快速殲滅之勢。好在當他們發現日軍四面合圍之時，朝鮮水軍在此處的火力也足以暫時應對，元均當即下令阻擊來犯之敵，同時出動三艘龜船沖入敵陣。
然而就在此時，海峽兩岸大批日軍突起，日將島津義弘、小西行長領兵五千佔據有利地形及沿岸險要，以陸上火炮開始向朝鮮戰船之上連續射擊，同時還在距離較近之處投擲焙烙玉。藤堂高虎的誘餌船隊也仗着鐵甲安宅船之堅固再度奮起反擊，日軍至此已經完成了對朝鮮水軍的徹底包圍。
日軍此次多為快船，但船隊中還加入四艘「大坂新艦隊」中抽調的巨艦，也就是改裝過後的京華武裝運輸艦。
此時前有藤堂高虎火力掩護，兩側沿岸有日軍火炮及火繩槍隊列密集射擊，前後有「新艦隊」四艘巨艦以大炮射擊，朝鮮炮手因此多有負傷，船甲破裂，風帆被毀，甲板洞穿甚至起火。
但即便如此，朝鮮一百七十餘艘戰船的火力仍給日軍造成了一定的傷亡，只是倭船中的「新艦隊巨艦」、安宅、關船大都已身覆鐵甲，因此朝鮮龜船也很難輕易對日本鐵甲船造成重創，至於那四艘巨艦更是所向披靡，堅不可摧的存在。
再加上朝鮮船隊集中於狹窄海域，行動不便，很快又被日軍的快船隊迅速接近實施接弦戰，近戰能力遠不及日軍的朝鮮水軍頓時便有不少士卒跳海逃生，結果大半被日軍火繩槍隊點名射殺。
元均見勢不好，又下意識地下令突圍，可惜此處已然是絕地，哪裏還能逃得掉？最終元均被日軍火繩槍命中陣亡，朝鮮陣亡水軍士兵數千人，一百五十餘艘戰船被日軍或是擊沉，或是俘獲，僅剩慶尚道右水使與宋希立率領十二艘戰船得以僥倖突出重圍，逃出生天。
戰後巨濟島方圓十五里內再無朝鮮船隻，朝鮮水軍遭受了近乎毀滅性的重創，水軍士氣徹底崩潰，再難進行任何海戰。而日軍方面則得以按照預定計劃，水陸並進向全羅道進軍。
漆川梁敗後，接到戰報的朝鮮王李昖驚惶不安，整個人的精神都幾乎垮掉了。李德馨勸道：「殿下，水軍全軍覆沒雖然十分慘痛，但此時卻萬萬不可氣餒。倭寇肅清水軍，很快便將從釜山及其餘港口侵入全羅道，然後北上攻向王京，眼下最急需的是立即應對。」
李恆福也勸道：「雖然明軍駐防軍北撤遼東整訓，但此前麻提督在丹東的大軍已經整訓了許久，值此危機時刻應該立刻向他請援，他畢竟是平倭提督，總不能不救吧？當然，我們也需要調派大軍與即將到來的明軍共同防禦。」
李昖急忙說道：「正是如此，正是如此，你們趕快去辦，調發我們的軍隊，還有李舜臣，寡人差點就忘了他，還是……先讓李舜臣官復原職吧。領相認為如何？這樣才如挽回局勢吧？」
到了這個時候才想起李舜臣，領議政柳成龍心中百感交集，但事到如今，他只能表示說理當如此。
但李德馨擔憂即便李舜臣官復原職，如今所能率領的戰船也所剩無幾，李昖聽後也暗自神傷。
左議政金應南此時道：「我軍水軍雖然損失慘重，但諸位似乎忘了一件事，明國方面從一開始就調集了一支水軍準備來朝作戰的，他們前一次因為在山東整訓太久，沒能趕上大戰，這一次難道還趕不上麼？
臣下建議立刻聯繫宋經略，他所部陸師要走是高閣老之命，他也違抗不得，那也就罷了，可是山東那支原本就打算來朝迎戰倭軍水軍的艦隊這次總該來了吧？
北洋海貿同盟的船隊都已經那般強大，想必這明軍水師自然更不必說，一旦陳璘提督水師來援，再有李舜臣從旁指點水文海況，擊敗倭軍水師必然易如反掌！」
此說一出，大家才恍然想起還有這麼一條大腿，連忙紛紛表示贊同，於是李昖趕緊派人去追宋應昌，請他通知陳璘趕緊來援。而另一面，接朝鮮王的王令，李舜臣也得以官復三道水軍統制使。
朝鮮水軍自漆川梁慘敗後，整一個頹廢喪志，每日只在虛度光陰，此時忽見李舜臣出現，頓時群情振奮。李舜臣在營中點兵，高聲喊道：「只要我們還在就不能說水軍滅亡，船可以再造，只要有一人仍有鬥志，水軍便在！諸位，我們不僅仍在，還將日漸壯大，向倭寇復仇，保衛家國！
裴興立、宋希立，立刻整理各水營情況向我匯報，李主簿和崔軍官，你二人匯總火藥、火炮、槍支情況，除重傷兵外立刻組織訓練！
造船需要一定的時間，但時不我待，需要日夜趕工，望諸位盡心盡力，朝鮮安危盡在我等肩上，切記切記。」
在他的激勵之下，朝鮮水軍轟然領命。
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